از سال 1364 معاونت های جنگ و پشتيبانی كه بعدها به نام معاونت دفاعی در دانشگاه ها تغيير نام پيدا كرد زير نظر رئيس دانشگاه تشكيل شد. عمده فعاليت اين معاونت، سازماندهی و اعزام دانشجويان داوطلب به جبهه و همچنين رسيدگی به مسائل آموزشی و غير آموزشی دانشجويان تحت پوشش بود. در سال هزار و سیصد و هفتاد در شورای عالی انقلاب فرهنگی بحث جايگزينی ادارات كل امور دانشجويان شاهد و ايثارگر به جای پست معاونت دفاعی مطرح شد كه بر اساس مصوبه 274 مورخ 1370/12/20 در شورای عالی انقلاب فرهنگی ايجاد اداره كل دانشجویان شاهد و ایثارگر در دانشگاه ها زير نظر رئيس دانشگاه تصويب شد. لازم به توضيح است كه قبلا در كنار اداره معاونت دفاعی، ستادی به نام ستاد شاهد وجود داشت كه مسئولیت رسیدگی به امور فرزندان شاهد را بر عهده داشت كه بر اساس مصوبه مذكور با معاونت دفاعی ادغام شد و اداره كل امور دانشجويان شاهد و ايثارگر جایگزین گردید.

در اجرای بند " هـ " ماده 5 آئین نامه جامع مدیریت دانشگاهها مصوب 1389/12/10 شورای عالی انقلاب فرهنگی در خصوص وظایف معاونت فرهنگی و اجتماعی و با عنایت به مذاکرات هیئت رئیسه دانشگاه مورخ 1392/12/25 در خصوص سیاست تحول ساختاری در دانشگاه؛ مدیریت امور شاهد و ایثارگر به عنوان یکی از مدیریت های تابعه معاونت فرهنگی و اجتماعی تعیین شد.

اهداف:

•  ترویج فرهنگ ایثار و شهادت و حفظ و حراست از آثار و پیام شهیدان و ایثارگران.
•  ارائه خدمات شایسته با حفظ عزت و کرامت به دانشجویان شاهد و ایثارگر در راستاي ارتقاي وضعیت آموزشی، فرهنگی و رفاهی آنان.
•  زمینه سازي براي مشارکت فعالانه دانشجویان شاهد و ایثارگر در عرصه‎هاي علمی، فرهنگی، پژوهشی، تحقیقاتی و اجتماعی در جهت رشد و تعالی بیشتر آنان.

شرح وظایف:

•  اجرای برنامه ها، طرح ها، آیین نامه ها و دستورالعمل های ارسالی از ستاد مرکزی یا اداره کل امور دانشجویان شاهد وایثارگر وزارت متبوع
•  پیگیری و اجرای مصوبات ستاد امور دانشجویان شاهد و ایثارگر دانشگاه
•  تهیه طرح های تقویت بنیه علمی دانشجویان شاهد و ایثارگر بمنظور پیشنهاد به ستاد برای تصویب
•  راه اندازی و تقویت کانون های علمی و فرهنگی ایثار در دانشگاه
•  تنظیم و ارائه پیشنهاد بودجه سالانه به ستاد شاهد و ایثارگر دانشگاه
•  پیگیری و جذب اعتبارات بمنظور پیشبرد برنامه ها و فعالیتهای مصوب از همه منابع ممکن
•  تنظیم تقویم سالیانه برگزاری جلسات ستاد امور دانشجویان شاهد و ایثارگر دانشگاه و ارسال بموقع صورتجلسات مربوطه به اداره کل امور دانشجویان شاهد و ایثارگر وزارت متبوع
•  اطلاع رسانی شایسته و به موقع به دانشجویان شاهد وایثارگر برای بهره مندی از امکانات و تسهیلات و خدمات گوناگون آموزشی، فرهنگی و رفاهی
• ایجاد بانک اطلاعاتی جامع از وضعیت آموزشی، فرهنگی، رفاهی و سلامت دانشجویان شاهد و ایثارگر و دانش آموختگان با همکاری حوزه های مختلف دانشگاه
• اجرای طرح تقویت بنیه علمی دانشجویان شاهد و ایثارگر از طریق برگزاری کلاسهای تقویتی، گروه های درسی و و...
• اجرای طرح استاد مشاور و برگزاری کارگاههای آموزشی و پژوهشی ویژه دانشجویان شاهد و ایثارگر و اساتید مشاور
• توجه خاص به دانشجویان در معرض خطر از نظر افت تحصیلی با انجام مشاوره های تحصیلی و حمایت های آموزشی و پژوهشی به منظور کاهش مشکلات تحصیلی ایشان
• پیگیری امور رفاهی دانشجویان شاهد و ایثارگر از طریق همکاری و هماهنگی با مسئولان دانشگاه و سایر نهادهای ذیربط
• جلب مشارکت دانشجویان شاهد و ایثارگر برای حضور فعال در برنامه های علمی، فرهنگی و پژوهشی و حمایت و پشتیبانی از پروژه های تحقیقاتی آنان
• برگزاری مراسم، جشنواره ها، مسابقات و ... در زمینه های علمی، فرهنگی، هنری، ورزشی و مانند آن و تشویق دانشجویان ممتاز
• تهیه گزارش عملکرد شش ماهه و سالانه و ارسال آن به اداره کل امور دانشجویان شاهد و ایثارگر وزارت متبوع و سازمان بنیاد شهید و امور ایثارگران استان
• تهیه گزارش عملکرد شش ماهه و سالانه و ارسال آن به اداره کل امور دانشجویان شاهد و ایثارگر وزارت متبوع و سازمان بنیاد شهید و امور ایثارگران استان
• همکاری و تعامل مناسب با بنیاد شهید و امور ایثارگران در جهت اجرای مطلوب برنامه های مصوب و در اختیار گذاشتن آمار و اطلاعات مورد نیاز حسب مورد